Las empresas que desarrollan bioinsumos, generalmente evalúan en campo la respuesta fisiológica de la planta con la cual se comprueba el uso potencial del producto Biológico; adicionalmente se realizan aislamientos de los microorganismos para comprobar su persistencia en el suelo, pero no siempre se obtienen las respuestas esperadas, debido a interferencia de la biota acompañante. Para garantizar la calidad de los productos desarrollados surgen las necesidades de ampliar la información relacionada con la formulación, a través de una caracterización genómica de los microorganismos que hacen parte del mismo, y del desarrollo de una técnica que posibilite la evaluación y seguimiento en campo de los microorganismos formulados en los productos. Se necesita contar con métodos más específicos, que faciliten el proceso de caracterización y determinación de la trazabilidad de los microorganismos presentes en el producto biológico, al igual que el desarrollo de un flujo de trabajo que permita la identificación de cepas luego de su aplicación en el suelo.
Este proceso aunque necesario es demasiado costoso dado el proceso de secuenciación, los análisis bioinformáticos y el alto rendimiento computacional requerido; sin embargo existen opciones que de acuerdo al tamaño del mismo se puede realizar con el secuenciador MinION, el cual es un equipo que permite la secuenciación directa de ADN / ARN, análisis en tiempo real, lecturas ultra largas - hasta 2 Mb, escalable a portátil o de escritorio, preparación sencilla y rápida, o automatizada, de la biblioteca, y altos rendimientos para genomas grandes.
Entre sus múltiples aplicaciones destaca la posibilidad de utilizarlo fuera del laboratorio, permitiendo, por ejemplo, el análisis de una muestra criminal en el mismo lugar del crimen, por parte de la policía científica.
El Minion es un dispositivo portátil de 90 g. En su núcleo se encuentra una celda de flujo que soporta hasta 2048 nanoporos direccionables individualmente que pueden controlarse en grupos de 512 mediante un circuito integrado de aplicación específica (ASIC). Antes de la secuenciación, los adaptadores se ligan a ambos extremos del ADN genómico o fragmentos de ADNc .
Estos adaptadores facilitan la captura de la cadena y la carga de una enzima posesiva en el extremo 5 'de una cadena.
La enzima es necesaria para garantizar el desplazamiento unidireccional de un solo nucleótido a lo largo de la cadena en una escala de tiempo de milisegundos.
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